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新品推荐:SuperScript® IV逆转录酶

发布时间: 2015-08-27

日期:2015-08-28         文章来源:Thermo fisher 官网

      轻松应对所有样品

Superscript® IV逆转录酶经专门设计,为RT-PCR及RT-qPCR的性能表现设立了全新标准。

  1.        显著提高了对多种影响cDNA合成的抑制剂的抵抗能力
  2.        可对多种样品类型进行可靠的特异性cDNA合成
  3.        逆转录反应更快速,孵育时间可从50+分钟减少至10分钟
  4.        相比SuperScript® III逆转录酶,持续合成能力显著提高

 SuperScript® IV逆转录酶可以独立的工具酶形式或首链合成系统形式提供。首链合成系统中包括dNTP、oligo(dT)20、随机六聚体、对照引物以及所需的缓冲液组分等。所有这些必需组分均分别装于独立管中,从而实现最优化的cDNA合成实验,确保每次实验的成功。

 

在存在反应抑制剂的情况下进行高效的逆转录反应

RNA样品中常见的抑制成分会影响cDNA合成过程,并给出假阴性的RT-qPCR结果。这些抑制剂包括RNA提取过程中使用的试剂以及得自生物样本的共提纯成分,例如胆盐、SDS或腐殖酸等(表1)。相比SuperScript® III逆转录酶及其他供应商提供的逆转录酶,SuperScript® IV逆转录酶对于污染性抑制剂具有显著的抗性(图1)。这有助于确保获得出色的结果,即使在处理含福尔马林及石蜡的RNA等低纯度RNA样品时依然表现如一。

图1.对存在生物抑制剂及样品制备抑制剂时的首链cDNA合成反应性能进行分析。根据所提供实验方案,在10 µL含oligo(dT)20 的SuperScript® IV逆转录酶反应体系中加入500 ng的0.5–10 Kb RNA Ladder。依照其他供应商所推荐的实验方案,使用其他供应商的逆转录酶进行实验。在引物退火或添加RT反应mix之前向总RNA中加入抑制剂。通过碱性凝胶电泳将首链cDNA分离出来,随后使用SYBR® Gold Nucleic Acid Gel Stain对cDNA进行染色。使用NaOH使所有RNA水解,从而仅对cDNA进行可视化分析。

对难处理样品及已降解RNA进行灵敏、可重复的cDNA合成

理想的逆转录酶可以对大多数难处理RNA样品进行成功的逆转录反应,例如由于制备过程中的降解反应而通常仅含较少的RNA转录本的得自植物样本的RNA。SuperScript® IV逆转录酶拥有极佳的可靠性和灵敏性,是对已降解RNA及含原料污染物的RNA进行cDNA合成的极佳选择(图2)。

 

图2.使用多种已降解植物RNA进行灵敏、可重复的cDNA合成,同时保持低突变水平。依照所提供的实验方案,在20 µL含随机六聚体引物的SuperScript® IV逆转录酶反应体系中使用1-100 ng的已降解拟南芥总RNA(RIN:1-3)。依照其他供应商所推荐的实验方案,使用其他供应商的逆转录酶进行实验。将RT反应所得的10%的cDNA加入到如图表标题所示的靶向TaqMan® Assays中。将平均Ct值对log10[起始RNA的ng数]进行描点绘图。另将每组起始RNA的标准差针对对测试的不同逆转录酶进行描点绘图。
RT反应:每组输入RNA中n=3,RT qPCR反应:每组RT反应中n=3。

高热稳定性适用于富含GC的模板以及反应中的持久性

RNA的二级茎环结构及富含GC的RNA模板均会影响cDNA合成。SuperScript® IV逆转录酶拥有极高的热稳定性,可在更高温度下(高至55oC)获得出色的表现,从而确保可对富含二级结构的RNA进行成功的逆转录反应(图3)。SuperScript® IV逆转录酶在RT反应全程中均可保持完整的反应活性,从而可在获得全长cDNA中有更佳的表现。

图3.SuperScript IV逆转录酶的高度热稳定性。根据所提供实验方案,在10 µL含oligo(dT)20的SuperScript® IV逆转录酶反应体系中加入500 ng的0.5–10 Kb RNA Ladder,但反应温度选取范围为50-65°C间。通过碱性凝胶电泳将首链cDNA分离出来,随后使用SYBR® Gold Nucleic Acid Gel Stain对cDNA进行染色。使用NaOH使所有RNA水解,从而仅对cDNA进行可视化分析。使用TotalLab软件对每条cDNA条带进行测量,将每组温度下所得的体积进行相加。使用每组反应温度下的总体积与50°C下的总体积相比,通过其比率计算得到反应活性百分比。

仅需10分钟的加速的cDNA合成以及高得率的cDNA制备。

SuperScript® IV逆转录酶可在十分钟内合成9 kb长的cDNA,这是SuperScript® III逆转录酶及其他竞争产品做不到的(图4、5)。

图4.快速的cDNA合成速率。根据所提供实验方案,在10 µL含oligo(dT)20的SuperScript® IV逆转录酶反应体系中加入500 ng的Millennium™ RNA Marker。依照其他供应商所推荐的实验方案,使用其他供应商的逆转录酶进行实验,但使用10分钟的反应时间。通过碱性凝胶电泳将首链cDNA分离出来,随后使用SYBR® Gold Nucleic Acid Gel Stain对cDNA进行染色。使用NaOH使所有RNA水解,从而仅对cDNA进行可视化分析。

 

图5.SuperScript® IV逆转录酶的cDNA合成实验方案简单,可轻松获得全长cDNA。





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